Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABRAXAS1Q6UWZ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ABRAXAS1Q6UWZ7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ABRAXAS1Q6UWZ7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ABRAXAS1Q6UWZ7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms