Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWE0

LRSAM1, E3 ubiquitin-protein ligase LRSAM1, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRSAM1Q6UWE0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRSAM1Q6UWE0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
LRSAM1Q6UWE0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
LRSAM1Q6UWE0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LRSAM1Q6UWE0 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LRSAM1Q6UWE0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms