Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW10

SFTA2, Surfactant-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTA2Q6UW10 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
SFTA2Q6UW10 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTA2Q6UW10 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTA2Q6UW10 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTA2Q6UW10 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTA2Q6UW10 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTA2Q6UW10 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
SFTA2Q6UW10 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SFTA2Q6UW10 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SFTA2Q6UW10 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SFTA2Q6UW10 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms