Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CCDC171Q6TFL3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CCDC171Q6TFL3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CCDC171Q6TFL3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CCDC171Q6TFL3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.45■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
CCDC171Q6TFL3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms