Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5L8

SHC4, SHC-transforming protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC4Q6S5L8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SHC4Q6S5L8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SHC4Q6S5L8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SHC4Q6S5L8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SHC4Q6S5L8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SHC4Q6S5L8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms