Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
DUX4L9Q6RFH8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DUX4L9Q6RFH8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
DUX4L9Q6RFH8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms