Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tcaf3Q6QR59 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tcaf3Q6QR59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tcaf3Q6QR59 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Tcaf3Q6QR59 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tcaf3Q6QR59 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tcaf3Q6QR59 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
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