Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJW8

CNST, Consortin, humanhuman

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNSTQ6PJW8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNSTQ6PJW8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CNSTQ6PJW8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNSTQ6PJW8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CNSTQ6PJW8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CNSTQ6PJW8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CNSTQ6PJW8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms