Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nudcd1Q6PIP5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nudcd1Q6PIP5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nudcd1Q6PIP5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nudcd1Q6PIP5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nudcd1Q6PIP5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms