Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ULK3Q6PHR2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ULK3Q6PHR2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ULK3Q6PHR2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms