Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Nup98Q6PFD9 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nup98Q6PFD9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Nup98Q6PFD9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Nup98Q6PFD9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Nup98Q6PFD9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nup98Q6PFD9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms