Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Zbtb40Q6PCS8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Zbtb40Q6PCS8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Zbtb40Q6PCS8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Zbtb40Q6PCS8 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Zbtb40Q6PCS8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Zbtb40Q6PCS8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zbtb40Q6PCS8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Zbtb40Q6PCS8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Zbtb40Q6PCS8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms