Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SLC27A1Q6PCB7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SLC27A1Q6PCB7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC27A1Q6PCB7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC27A1Q6PCB7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SLC27A1Q6PCB7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms