Protein–RNA interactions for Protein: Q6P995

FAM171B, Protein FAM171B, humanhuman

Predictions only

Length 826 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM171BQ6P995 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM171BQ6P995 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM171BQ6P995 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FAM171BQ6P995 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM171BQ6P995 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM171BQ6P995 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM171BQ6P995 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM171BQ6P995 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM171BQ6P995 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM171BQ6P995 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM171BQ6P995 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM171BQ6P995 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM171BQ6P995 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms