Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CASC4Q6P4E1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CASC4Q6P4E1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CASC4Q6P4E1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CASC4Q6P4E1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms