Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NEK5Q6P3R8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NEK5Q6P3R8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEK5Q6P3R8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEK5Q6P3R8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 962.9 ms