Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2B1

Tnpo3, Transportin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo3Q6P2B1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Tnpo3Q6P2B1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tnpo3Q6P2B1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tnpo3Q6P2B1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tnpo3Q6P2B1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tnpo3Q6P2B1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tnpo3Q6P2B1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo3Q6P2B1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo3Q6P2B1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo3Q6P2B1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo3Q6P2B1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo3Q6P2B1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo3Q6P2B1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo3Q6P2B1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo3Q6P2B1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tnpo3Q6P2B1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms