Protein–RNA interactions for Protein: Q6NY19

KANK3, KN motif and ankyrin repeat domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KANK3Q6NY19 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KANK3Q6NY19 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.7■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
KANK3Q6NY19 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
KANK3Q6NY19 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KANK3Q6NY19 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KANK3Q6NY19 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms