Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Szrd1Q6NXN1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Szrd1Q6NXN1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Szrd1Q6NXN1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Szrd1Q6NXN1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Szrd1Q6NXN1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms