Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Wdr44Q6NVE8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr44Q6NVE8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr44Q6NVE8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr44Q6NVE8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Wdr44Q6NVE8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr44Q6NVE8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Wdr44Q6NVE8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Wdr44Q6NVE8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Wdr44Q6NVE8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Wdr44Q6NVE8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Wdr44Q6NVE8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms