Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CAPN13Q6MZZ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CAPN13Q6MZZ7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CAPN13Q6MZZ7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CAPN13Q6MZZ7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms