Protein–RNA interactions for Protein: Q6L8S8

B4galnt3, Beta-1,4-N-acetylgalactosaminyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4galnt3Q6L8S8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
B4galnt3Q6L8S8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
B4galnt3Q6L8S8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
B4galnt3Q6L8S8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
B4galnt3Q6L8S8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
B4galnt3Q6L8S8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
B4galnt3Q6L8S8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms