Protein–RNA interactions for Protein: Q6KC79

NIPBL, Nipped-B-like protein, humanhuman

eCLIP

Length 2,804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPBLQ6KC79 USP39-216ENST00000490193 1028 ntTSL 57.81□□□□□ -1.165e-6■■■■■ 32.2
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NIPBLQ6KC79 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.185e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 HIP1-206ENST00000485723 419 ntTSL 27.59□□□□□ -1.195e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 CDC42BPA-210ENST00000462553 430 ntTSL 57.55□□□□□ -1.25e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 CENPP-203ENST00000375587 8766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.265e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SCHLAP1-201ENST00000629145 1436 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.295e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SPIDR-224ENST00000524126 2614 ntTSL 1 (best)6.93□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SPIDR-225ENST00000524141 2761 ntTSL 26.92□□□□□ -1.35e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-213ENST00000508777 1387 ntTSL 1 (best)6.73□□□□□ -1.335e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SPIDR-223ENST00000524033 1023 ntTSL 26.63□□□□□ -1.355e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SCLY-220ENST00000497951 3800 ntTSL 26.51□□□□□ -1.375e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 PTTG1-204ENST00000519287 670 ntTSL 56.49□□□□□ -1.375e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC6.43□□□□□ -1.385e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SPIDR-213ENST00000521214 3577 ntTSL 26.37□□□□□ -1.395e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-223ENST00000514036 575 ntTSL 46.32□□□□□ -1.45e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-212ENST00000508315 579 ntTSL 46.32□□□□□ -1.45e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC6.22□□□□□ -1.415e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 PSMD2-210ENST00000463602 576 ntTSL 45.96□□□□□ -1.465e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-209ENST00000507276 584 ntTSL 45.95□□□□□ -1.465e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-218ENST00000512305 542 ntTSL 45.92□□□□□ -1.465e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-204ENST00000503222 562 ntTSL 45.92□□□□□ -1.465e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-227ENST00000515448 522 ntTSL 45.92□□□□□ -1.465e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 GTPBP10-202ENST00000257659 1740 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.475e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.475e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SLC38A1-201ENST00000398637 8066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.495e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 HERC4-202ENST00000373700 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.495e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 OR51B2-201ENST00000624187 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.495e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 PTTG1-203ENST00000517480 684 ntTSL 55.54□□□□□ -1.525e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 PTTG1-207ENST00000524244 434 ntTSL 25.49□□□□□ -1.535e-6■■■■■ 32.2
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NIPBLQ6KC79 USP39-219ENST00000496047 554 ntTSL 35.34□□□□□ -1.555e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.555e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 HIP1-204ENST00000434438 7066 ntTSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.575e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 HIP1-201ENST00000336926 8013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.585e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 BABAM2-203ENST00000361704 1686 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.65e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-219ENST00000512625 554 ntTSL 44.94□□□□□ -1.625e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.625e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.625e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.635e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.645e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 BABAM2-201ENST00000342045 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.655e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 TEX15-202ENST00000518257 577 ntTSL 44.59□□□□□ -1.685e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 RAI14-210ENST00000507502 340 ntTSL 34.53□□□□□ -1.685e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 USP25-209ENST00000547201 757 ntTSL 24.44□□□□□ -1.75e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 HERC4-209ENST00000473533 3593 ntTSL 1 (best)4.35□□□□□ -1.715e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 GTPBP10-208ENST00000450619 856 ntTSL 54.35□□□□□ -1.715e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.755e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.765e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.765e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 GTPBP10-206ENST00000426366 778 ntTSL 53.8□□□□□ -1.85e-6■■■■■ 32.2
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NIPBLQ6KC79 HERC4-206ENST00000427635 6391 ntTSL 23.17□□□□□ -1.95e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.9□□□□□ -1.955e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 USP25-210ENST00000549362 606 ntTSL 22.71□□□□□ -1.985e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.985e-6■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 PTTG1-206ENST00000523659 851 ntTSL 22.66□□□□□ -1.985e-6■■■■■ 32.2
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NIPBLQ6KC79 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.135e-6■■■■■ 32.2
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NIPBLQ6KC79 LINC02001-202ENST00000638682 1504 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -16e-8■■■■■ 32.2
NIPBLQ6KC79 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.877e-7■■■■■ 32
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NIPBLQ6KC79 COG5-208ENST00000475638 592 ntTSL 32.42□□□□□ -2.027e-7■■■■■ 32
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NIPBLQ6KC79 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.866e-39■■■■■ 31.8
NIPBLQ6KC79 CEP295-203ENST00000530425 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 42.58□□□□□ -26e-39■■■■■ 31.8
NIPBLQ6KC79 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.033e-8■■■■■ 31.8
NIPBLQ6KC79 GMPR-203ENST00000543191 675 ntTSL 28.44□□□□□ -1.063e-8■■■■■ 31.8
NIPBLQ6KC79 COA1-204ENST00000415076 1737 ntTSL 37.48□□□□□ -1.213e-6■■■■■ 31.7
NIPBLQ6KC79 COA1-210ENST00000446330 1520 ntTSL 26.2□□□□□ -1.423e-6■■■■■ 31.7
NIPBLQ6KC79 COA1-211ENST00000446564 1177 ntTSL 25.54□□□□□ -1.523e-6■■■■■ 31.7
NIPBLQ6KC79 SACS-203ENST00000423156 1709 ntTSL 213.97□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 31.7
NIPBLQ6KC79 SACS-204ENST00000455470 2784 ntTSL 1 (best)7.39□□□□□ -1.232e-6■■■■■ 31.7
NIPBLQ6KC79 SACS-202ENST00000402364 15134 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.452e-6■■■■■ 31.7
NIPBLQ6KC79 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.53□□□□□ -22e-6■■■■■ 31.7
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NIPBLQ6KC79 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.95□□□□□ -0.349e-12■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.812e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 RBAK-201ENST00000353796 4125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.889e-12■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 DMTF1-202ENST00000394703 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.942e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.969e-12■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 DMTF1-238ENST00000584619 1645 ntTSL 57.98□□□□□ -1.132e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.612e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 DMTF1-213ENST00000432937 2411 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.652e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 DMTF1-227ENST00000579677 3915 ntTSL 1 (best)4.65□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 DMTF1-216ENST00000447863 3954 ntTSL 1 (best)4.59□□□□□ -1.672e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 DMTF1-228ENST00000579850 3483 ntTSL 53.88□□□□□ -1.792e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 DMTF1-208ENST00000425406 3868 ntTSL 23.77□□□□□ -1.812e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 DMTF1-224ENST00000547146 3657 ntTSL 52.33□□□□□ -2.042e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 NCL-208ENST00000466274 671 ntTSL 25.9□□□□□ -1.462e-43■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.012e-43■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 ATP5B-203ENST00000547808 705 ntTSL 517.47■□□□□ 0.392e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 ATP5B-207ENST00000551020 856 ntTSL 316.16■□□□□ 0.182e-6■■■■■ 31.5
NIPBLQ6KC79 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 31.5
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