Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CltbQ6IRU5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CltbQ6IRU5 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CltbQ6IRU5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CltbQ6IRU5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CltbQ6IRU5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms