Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q6GQU0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6GQU0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6GQU0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6GQU0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6GQU0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6GQU0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6GQU0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6GQU0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q6GQU0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6GQU0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6GQU0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6GQU0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6GQU0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Q6GQU0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Q6GQU0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6GQU0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6GQU0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Q6GQU0 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6GQU0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6GQU0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q6GQU0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Q6GQU0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Q6GQU0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6GQU0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Q6GQU0 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms