Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SMYD5Q6GMV2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SMYD5Q6GMV2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
SMYD5Q6GMV2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SMYD5Q6GMV2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SMYD5Q6GMV2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMYD5Q6GMV2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMYD5Q6GMV2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SMYD5Q6GMV2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms