Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SFRP4Q6FHJ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SFRP4Q6FHJ7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP4Q6FHJ7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP4Q6FHJ7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP4Q6FHJ7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SFRP4Q6FHJ7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP4Q6FHJ7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP4Q6FHJ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP4Q6FHJ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP4Q6FHJ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP4Q6FHJ7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms