Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Scaf8Q6DID3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Scaf8Q6DID3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Scaf8Q6DID3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Scaf8Q6DID3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Scaf8Q6DID3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Scaf8Q6DID3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Scaf8Q6DID3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms