Protein–RNA interactions for Protein: Q6A068

Cdc5l, Cell division cycle 5-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc5lQ6A068 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdc5lQ6A068 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdc5lQ6A068 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdc5lQ6A068 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdc5lQ6A068 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc5lQ6A068 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cdc5lQ6A068 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc5lQ6A068 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cdc5lQ6A068 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdc5lQ6A068 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cdc5lQ6A068 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc5lQ6A068 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc5lQ6A068 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdc5lQ6A068 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdc5lQ6A068 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cdc5lQ6A068 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms