Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pdzrn3Q69ZS0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pdzrn3Q69ZS0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pdzrn3Q69ZS0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pdzrn3Q69ZS0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
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