Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZA1

Cdk13, Cyclin-dependent kinase 13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk13Q69ZA1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Cdk13Q69ZA1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cdk13Q69ZA1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Cdk13Q69ZA1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cdk13Q69ZA1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cdk13Q69ZA1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Cdk13Q69ZA1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Cdk13Q69ZA1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
Cdk13Q69ZA1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Cdk13Q69ZA1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Cdk13Q69ZA1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cdk13Q69ZA1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cdk13Q69ZA1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Cdk13Q69ZA1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cdk13Q69ZA1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Cdk13Q69ZA1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Cdk13Q69ZA1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Cdk13Q69ZA1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Cdk13Q69ZA1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdk13Q69ZA1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdk13Q69ZA1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Cdk13Q69ZA1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cdk13Q69ZA1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cdk13Q69ZA1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
Cdk13Q69ZA1 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Cdk13Q69ZA1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cdk13Q69ZA1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Cdk13Q69ZA1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Cdk13Q69ZA1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cdk13Q69ZA1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cdk13Q69ZA1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Cdk13Q69ZA1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdk13Q69ZA1 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Cdk13Q69ZA1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Cdk13Q69ZA1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cdk13Q69ZA1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Cdk13Q69ZA1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdk13Q69ZA1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
Cdk13Q69ZA1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdk13Q69ZA1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdk13Q69ZA1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Cdk13Q69ZA1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Cdk13Q69ZA1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cdk13Q69ZA1 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cdk13Q69ZA1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms