Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD5

Cltc, Clathrin heavy chain 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltcQ68FD5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
CltcQ68FD5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CltcQ68FD5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CltcQ68FD5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
CltcQ68FD5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CltcQ68FD5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
CltcQ68FD5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CltcQ68FD5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CltcQ68FD5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CltcQ68FD5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
CltcQ68FD5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
CltcQ68FD5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
CltcQ68FD5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CltcQ68FD5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CltcQ68FD5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
CltcQ68FD5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
CltcQ68FD5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
CltcQ68FD5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
CltcQ68FD5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
CltcQ68FD5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CltcQ68FD5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CltcQ68FD5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CltcQ68FD5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CltcQ68FD5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
CltcQ68FD5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
CltcQ68FD5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
CltcQ68FD5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
CltcQ68FD5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
CltcQ68FD5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CltcQ68FD5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC34.08■■■■□ 3.05
CltcQ68FD5 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.07■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC34.03■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
CltcQ68FD5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CltcQ68FD5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
CltcQ68FD5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CltcQ68FD5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
CltcQ68FD5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
CltcQ68FD5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CltcQ68FD5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CltcQ68FD5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
CltcQ68FD5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
CltcQ68FD5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
CltcQ68FD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
CltcQ68FD5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
CltcQ68FD5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
CltcQ68FD5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
CltcQ68FD5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CltcQ68FD5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
CltcQ68FD5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
CltcQ68FD5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CltcQ68FD5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms