Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
INTS3Q68E01 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.15■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
INTS3Q68E01 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
INTS3Q68E01 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.04■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
INTS3Q68E01 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
INTS3Q68E01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms