Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Knl1Q66JQ7 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Knl1Q66JQ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Knl1Q66JQ7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Knl1Q66JQ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Knl1Q66JQ7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Knl1Q66JQ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Knl1Q66JQ7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Knl1Q66JQ7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Knl1Q66JQ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Knl1Q66JQ7 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Knl1Q66JQ7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Knl1Q66JQ7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Knl1Q66JQ7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Knl1Q66JQ7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Knl1Q66JQ7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Knl1Q66JQ7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Knl1Q66JQ7 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms