Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hoxa13Q62424 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hoxa13Q62424 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Hoxa13Q62424 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hoxa13Q62424 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Hoxa13Q62424 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
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