Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtmQ62388 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AtmQ62388 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtmQ62388 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AtmQ62388 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtmQ62388 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AtmQ62388 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
AtmQ62388 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AtmQ62388 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AtmQ62388 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtmQ62388 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AtmQ62388 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AtmQ62388 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtmQ62388 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AtmQ62388 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.3 ms