Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Aldh1a2Q62148 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Aldh1a2Q62148 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Aldh1a2Q62148 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Aldh1a2Q62148 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Aldh1a2Q62148 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms