Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkciQ62074 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkciQ62074 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkciQ62074 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkciQ62074 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PrkciQ62074 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkciQ62074 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkciQ62074 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkciQ62074 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkciQ62074 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PrkciQ62074 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PrkciQ62074 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PrkciQ62074 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PrkciQ62074 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PrkciQ62074 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkciQ62074 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PrkciQ62074 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkciQ62074 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkciQ62074 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkciQ62074 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PrkciQ62074 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkciQ62074 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkciQ62074 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PrkciQ62074 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkciQ62074 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PrkciQ62074 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PrkciQ62074 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms