Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Lama3Q61789 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lama3Q61789 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lama3Q61789 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Lama3Q61789 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lama3Q61789 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lama3Q61789 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms