Protein–RNA interactions for Protein: Q61656

Ddx5, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 614 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx5Q61656 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx5Q61656 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ddx5Q61656 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx5Q61656 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ddx5Q61656 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx5Q61656 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx5Q61656 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx5Q61656 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx5Q61656 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx5Q61656 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx5Q61656 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx5Q61656 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx5Q61656 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx5Q61656 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms