Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Trim25Q61510 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trim25Q61510 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Trim25Q61510 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trim25Q61510 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms