Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BcanQ61361 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BcanQ61361 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BcanQ61361 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
BcanQ61361 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
BcanQ61361 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
BcanQ61361 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
BcanQ61361 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
BcanQ61361 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
BcanQ61361 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
BcanQ61361 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BcanQ61361 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
BcanQ61361 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BcanQ61361 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BcanQ61361 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BcanQ61361 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
BcanQ61361 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BcanQ61361 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BcanQ61361 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BcanQ61361 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BcanQ61361 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
BcanQ61361 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BcanQ61361 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
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