Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mre11Q61216 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mre11Q61216 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mre11Q61216 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Mre11Q61216 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Mre11Q61216 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mre11Q61216 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms