Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf4bQ61136 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf4bQ61136 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf4bQ61136 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Prpf4bQ61136 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf4bQ61136 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf4bQ61136 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Prpf4bQ61136 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Prpf4bQ61136 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf4bQ61136 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Prpf4bQ61136 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Prpf4bQ61136 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Prpf4bQ61136 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Prpf4bQ61136 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Prpf4bQ61136 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Prpf4bQ61136 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms