Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NinQ61043 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NinQ61043 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
NinQ61043 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NinQ61043 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NinQ61043 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NinQ61043 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NinQ61043 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
NinQ61043 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NinQ61043 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
NinQ61043 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinQ61043 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinQ61043 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinQ61043 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinQ61043 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinQ61043 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NinQ61043 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NinQ61043 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinQ61043 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinQ61043 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinQ61043 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NinQ61043 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NinQ61043 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NinQ61043 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NinQ61043 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NinQ61043 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NinQ61043 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NinQ61043 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NinQ61043 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NinQ61043 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NinQ61043 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NinQ61043 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NinQ61043 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NinQ61043 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NinQ61043 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NinQ61043 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NinQ61043 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NinQ61043 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NinQ61043 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NinQ61043 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NinQ61043 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NinQ61043 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
NinQ61043 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NinQ61043 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NinQ61043 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NinQ61043 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NinQ61043 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NinQ61043 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NinQ61043 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NinQ61043 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NinQ61043 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NinQ61043 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NinQ61043 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NinQ61043 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NinQ61043 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NinQ61043 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NinQ61043 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NinQ61043 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NinQ61043 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NinQ61043 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NinQ61043 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NinQ61043 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NinQ61043 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NinQ61043 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NinQ61043 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NinQ61043 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NinQ61043 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NinQ61043 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NinQ61043 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NinQ61043 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NinQ61043 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NinQ61043 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NinQ61043 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NinQ61043 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NinQ61043 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NinQ61043 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NinQ61043 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NinQ61043 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NinQ61043 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NinQ61043 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NinQ61043 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NinQ61043 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NinQ61043 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NinQ61043 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NinQ61043 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NinQ61043 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NinQ61043 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NinQ61043 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NinQ61043 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NinQ61043 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NinQ61043 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NinQ61043 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NinQ61043 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NinQ61043 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NinQ61043 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NinQ61043 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NinQ61043 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NinQ61043 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NinQ61043 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NinQ61043 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms