Protein–RNA interactions for Protein: Q61035

Hars, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HarsQ61035 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HarsQ61035 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HarsQ61035 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HarsQ61035 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HarsQ61035 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HarsQ61035 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HarsQ61035 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HarsQ61035 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HarsQ61035 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HarsQ61035 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HarsQ61035 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HarsQ61035 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HarsQ61035 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HarsQ61035 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HarsQ61035 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HarsQ61035 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HarsQ61035 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HarsQ61035 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HarsQ61035 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94 ms