Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppp1r1bQ60829 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Ppp1r1bQ60829 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ppp1r1bQ60829 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Ppp1r1bQ60829 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppp1r1bQ60829 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppp1r1bQ60829 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ppp1r1bQ60829 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ppp1r1bQ60829 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ppp1r1bQ60829 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ppp1r1bQ60829 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp1r1bQ60829 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp1r1bQ60829 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ppp1r1bQ60829 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ppp1r1bQ60829 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ppp1r1bQ60829 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ppp1r1bQ60829 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms