Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Csnk2a1Q60737 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Csnk2a1Q60737 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Csnk2a1Q60737 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Csnk2a1Q60737 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csnk2a1Q60737 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csnk2a1Q60737 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.6 ms