Protein–RNA interactions for Protein: Q60710

Samhd1, Deoxynucleoside triphosphate triphosphohydrolase SAMHD1, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samhd1Q60710 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Samhd1Q60710 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Samhd1Q60710 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Samhd1Q60710 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Samhd1Q60710 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Samhd1Q60710 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Samhd1Q60710 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms