Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxd4Q60688 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Foxd4Q60688 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Foxd4Q60688 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Foxd4Q60688 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Foxd4Q60688 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms